當公司以存貨抵押負債時，會涉及到兩個主要會計處理：一是減少存貨賬面價值，二是減少相應的負債金額。在稅務方面，這種交易可能需要考慮增值稅的影響，因為存貨的轉移可能被視為一種銷售行為。具體稅務處理可能因具體情況而異，建議查閱最新的稅務規定或咨詢稅務專業人士。