合作社收購社員的茶葉并進行加工銷售，如果合作社是一般納稅人且茶葉交易開具了增值稅專用發票，那么這部分進項稅額是可以用來抵扣銷項稅額的。具體操作是在計算當期應納稅額時，將這部分進項稅額從銷項稅額中扣除，從而減少應繳的稅款。