總公司是100%控股，分公司是獨立法人，獨立核算體系

在這種情況下，總公司完全可以向分公司開具發票。由于分公司是獨立法人且有獨立的核算體系，總公司與分公司之間的交易需要遵循正常的市場交易規則，包括開具發票和繳納相應的稅費。這樣做有助于確保財務透明和稅務合規。