單位可以僅使用電子會計憑證進行報銷入賬歸檔，但需要滿足一系列條件，包括接收的電子會計憑證必須合法、真實，電子會計憑證的傳輸、存儲必須安全、可靠，使用的會計核算系統能夠準確、完整、有效接收和讀取電子會計憑證及其元數據，并設定了必要的審簽程序。 對于與電子發票相關的記賬憑證、報銷憑證等，如果未實現電子化，單位應單獨將電子發票通過歸檔接口或手工導入電子檔案管理系統進行整理、歸檔并長期保存。對于已實施會計信息系統的單位，與電子發票相關的記賬憑證、報銷憑證等如已全部實現電子化，可以將電子發票與相關的記賬憑證、報銷憑證等移交會計檔案管理人員保存。 電子發票的歸檔和管理還需要符合《會計檔案管理辦法》等相關要求。例如，電子發票的歸檔應當真實、完整、可用和安全，便于檢索和查詢。歸檔的電子發票應當保持原貌，并應當具有防篡改功能。歸檔的電子發票應當設置歸檔標識，歸檔后不得修改。同時，電子發票的保管應當符合國家有關規定，可以通過設定查閱權限、進行加密處理等方式，確保電子發票不被篡改、損壞，防止電子發票丟失。