同學您好，遇到企業所得稅匯算清繳已扣除稅金及附加與實際入庫數據不一致的問題，首先應核對相關稅務申報表和入庫憑證，確認差異原因。如果是因為計算錯誤或錄入錯誤，應及時更正并重新申報。如果是由于稅務政策調整或其他原因導致的差異，應咨詢稅務部門并按照規定處理。