在進行個稅匯算清繳時，員工的預填信息通常是由員工自己在個人所得稅APP或自然人電子稅務局的網站上自行完成。企業作為扣繳義務人，其責任是確保員工的稅務信息正確無誤，并按時申報繳納稅款。 關于年收入不超過12萬且需要匯算清繳的納稅人可以免辦理個稅匯算清繳的規定，這并不意味著企業需要代替員工操作。這個政策是對個人的優惠，符合條件的人可以自行選擇是否進行匯算清繳。同樣，補稅不超過400元的納稅人也可以選擇不辦理匯算清繳，這也是個人的選擇，企業無需代為辦理。 如果員工沒有下載個稅申報App或未進行應做的匯算清繳，企業并沒有直接責任。但是，企業有責任提醒員工按時完成個稅匯算清繳，以確保企業整體的稅務合規性。 企業可以通過自然人電子稅務局扣繳端查詢員工的申報情況。如果發現員工有應補未補的情況，企業可以提醒員工盡快完成補稅