公司以車抵債的賬務處理，應將車輛的賬面價值轉入固定資產清理科目，并確認相關稅費。然后，將收到的債務金額與固定資產清理金額的差額，確認為資產處置損益科目。同時，根據稅法規定，公司應繳納增值稅、附加稅等稅費。