加計扣除5%的進項稅后，計算對應的附加稅時，應該按照加計扣除前的實際增值稅進項稅額計提。加計扣除5%的進項稅是一種稅收優惠政策，用于鼓勵企業增加研發投入，提高創新能力。在實際操作中，企業可以在計算應納稅額時，按照規定加計扣除5%的進項稅額，從而減少應納稅額。但是，在計算附加稅時，應該以加計扣除前的實際增值稅進項稅額為基礎進行計算，因為附加稅是依據實際繳納的增值稅稅額來計提的。因此，如果企業享受了加計扣除5%的進項稅政策，那么在計算附加稅時，應該以加計扣除前的實際增值稅進項稅額為基礎進行計算，而不是扣除后的金額。