是的，軟件開發合同需要繳納印花稅。根據《中華人民共和國印花稅法》，軟件開發合同屬于“技術合同”類別，應當按價款的0.05%繳納印花稅。繳納印花稅的方式是在合同簽訂后，由合同雙方當事人向當地稅務部門申報繳納。 需要注意的是，印花稅是地方稅種，具體繳納方式和標準可能會因地區而有所不同。此外，如果軟件開發合同中包含多個不同類型的交易，例如軟件定制開發、技術咨詢等，可能需要根據不同類型交易分別計算印花稅。因此，在簽訂軟件開發合同時，建議合同雙方當事人仔細閱讀當地稅務部門的相關規定，以避免不必要的稅務風險。