自己委托自己嗎？

是個體戶委托法人收款。

那反過來，與個人簽訂的合同，但個人為公司法人，以公司名稱開具的發票，個人也簽訂了授權委托書叫我公司將款項轉入他的公司賬戶上，這種種也造成了個人與開票和收款單位不一致的情況了達？

你好是的，也是可以的。

我們公司內審這邊提出質疑說不能這樣操作

你好，審計的時候通不過是很正常的。

叫我們也整改反饋意見，都不曉得咋弄

你好，那你這個得問他，確實沒有好的辦法，除非就是重新又按正規的走一遍。