這個電子普通發票的話，這個40.98的稅可以抵扣進項嗎

不可以抵扣的，因為這個是代理服務的發票。

員工說用的電子登機牌，只有這一個發票，能報銷嗎，說是有發票，就不能打印了，在機場應該可以打印吧？

電子登機牌他有證明嗎？有證明的可以啊。