辦理退稅商店資格備案的流程首先要持有營業(yè)執(zhí)照，然后在財政部門登記機構(gòu)代碼，完善組織機構(gòu)代碼檔案，并在工商行政管理局核發(fā)全國統(tǒng)一社會信用代碼和稅務登記證。此外，還需要遞交相關資料，如營業(yè)執(zhí)照、組織機構(gòu)代碼證、稅務登記證、全國統(tǒng)一社會信用代碼證件等，最后需要在相關部門簽署一份表格，并經(jīng)過審核后即可完成退稅商店資格備案的流程。 拓展知識：根據(jù)《中華人民共和國國家稅務總局關于確定國家稅務總局辦稅服務廳接收稅務登記材料相關事項的通知》的相關規(guī)定，辦理稅務登記材料時要持有營業(yè)執(zhí)照、組織機構(gòu)代碼證和稅務登記證三張證書。