根據目前的稅收政策，個人獨資企業應分開繳納經營所得稅和個人所得稅。經營所得稅是企業利潤所得稅，是指企業在一定的財務會計期間內產生的，而個人所得稅是對個人在一定的財務會計期間內產生的所得做出的稅收征收。因此，個人獨資企業應分開繳納經營所得稅和個人所得稅。