注銷跨區稅源登記的操作步驟如下： 1. 申請人持有效證件到原發票領域稅務機關辦理注銷跨區稅源登記。 2. 申請人按照稅務機關要求提供相關材料，并簽署注銷跨區稅源登記聲明書。 3. 稅務機關審核相關材料后，核發注銷跨區稅源登記憑證。 4. 注銷成功后，在原發票領域稅務機關對該納稅人的稅源登記狀態進行修改，把稅源登記狀態標記為“已注銷”。