享受基礎研究出資加計扣除優惠政策，企業應留存包括但不限于以下材料：1、科研項目審批文件；2、科研項目實施報告及收支明細；3、科研成果證明材料；4、科研支出發票；5、科研活動費及其他支出的經濟性證明材料。 舉個例子：某制造企業的研發投入后，研發部門完成了一項發明專利的開發，獲得了國家專利證書和發明專利授權書，該企業依據《企業所得稅法》第二十八條的規定，申請了基礎研究出資加計扣除優惠政策，應當留存上述材料以備外部審計或稅務稽查。