事業單位專項款的記賬科目主要有“專用基金收入”、“專用基金支出”、“專用基金本幣替代外幣”等項目。 具體來說，針對專用基金收入，當單位收到的專項款來源于中央或者地方政府時，可以在“一般公共預算收入”科目下記賬；當收到的專項款來源于外部社會資本時，則可以在“政府經費收入”科目下記賬；同時，當收到的專項款有外幣組成時，仍可以在以上兩項科目下記賬，但需要記錄本幣和外幣的匯率差額，記入“專用基金本幣替代外幣”科目下。 對于專用基金支出，單位可以按照“公共支出”、“其他支出”等科目，根據實際的資金使用情況來把要支付的費用分類記賬。當專用基金的支出有外幣組成時，仍可以在以上兩項科目下記賬，但需要記錄本幣和外幣的匯率差額，記入“專用基金本幣替代外幣”科目下。 以上就是事業單位專項款的記賬科目，確保單位能夠準確、精確的記賬和使用，將單位的專項款利用起來，發揮最大的社會效益。