您好！分公司獨立核算時，并不影響總公司匯總申報企業所得稅。因為，分公司獨立核算是指分公司在納稅期間獨立申報繳納稅款，不影響總公司匯總申報繳納稅款，而總公司匯總申報企業所得稅是指對多個分公司，由總公司總計匯總各分公司的企業所得稅，由總公司申報繳納稅款。因此，分公司獨立核算不會影響總公司匯總申報企業所得稅的情況。