企業完稅證明的開具流程包括：1.企業擬開具完稅證明的，需要提前收集財務憑證和稅務資料，及納稅人相關注冊資料；2.準備完畢后，繳納稅款，出具完稅憑證，此憑證具有法律效應；3.稅務機關出具完稅證明，此證明具有法律效力；4.完稅后，本企業可結算各項應稅款，并可在稅務機關查驗完稅證明，以及查驗稅收憑證。總而言之，完稅證明的開具流程需要企業收集有關資料，繳納稅款，并由稅務機關出具。