一般情況下，有余額可以支付合同毛利對沖工程，這就要求結算時的精確核算，應該考慮設備費用、人工費用、管理成本等，確保精確核算不會出現余額。如果發現有余額，可協商雙方做出調整，也可以將余額存入雙方指定的銀行賬戶或其他賬戶中，交由法院進行裁決或由雙方協商決定。