分公司和總公司之間做賬的主要聯系是在進行報表的匯總和分析，以確保企業的整體財務狀況反映真實情況。母公司和子公司之間的主要聯系是會計整合，即通過將母公司賬戶中的財務數據與子公司財務數據進行匹配和對比，以確保這些數據的有效性和準確性。