小規模納稅人普票免稅的金額應該記入營業外收入。按國家稅務總局《企業所得稅納稅申報糾紛處理規定》第三十七條規定，小規模納稅人普通發票免稅的金額應記入營業外收入；根據有關法律法規的規定，小規模納稅人普通發票免稅的金額應以1%的稅率記入收入，即免征收1%的企業所得稅；或者，以便納稅人有效控制企業所得稅，可以按照3%的稅率記入收入，即免征收3%的企業所得稅。