根據《企業所得稅法》規定，印花稅應當依據納稅人實際簽訂的合同價格繳納，而不應當按發票的金額繳納，因此，這筆合同應繳納100萬元印花稅。拓展知識：印花稅是企業和單位在進行債權、債務和買賣轉讓合同時，財政部門收取稅款的一種稅種，一般認為是固定稅率征收，但從實踐中發現，以印花稅稅率分為低稅率和高稅率，實際的稅率時可以根據合同種類及印花稅的征收稅率有所不同。