公司退稅的新準則主要以實際營業收入為基礎，適用于收入稅的納稅人。根據所得稅法，可以根據適用稅率表，計算應繳稅款，并在歷史記錄中保留15年，以便對繳稅狀況進行檢查。此外，還應按照有關規定，在計算應繳稅款時應進行適當的扣除，以降低負擔，促進企業發展。