小微企業收到的退稅款一般可以在會計賬簿的應交稅款科目下登記，根據稅款種類以及實際退稅金額計算具體的憑證，例如應交增值稅的退稅，可以分別登記貸方的增值稅進項稅額和借方的應交稅款科目，把實際退稅金額以貸方的金額登記到會計賬簿中。