對于收到的合同預付款未開發票的入賬，要按照企業的財務管理制度和規定進行處理。首先，應登記出納登記本中的預付款科目，入賬時記賬時間為收款日期。其次，應當登記財務工作本中的應付款科目，登記該條款科目，入賬時正負值應該相應變化，以保證企業資產負值；最后，應當填寫收款單據，把單據報送財務總監審核。總之，企業在收到預付款未開發票的情況下，應按照上述步驟進行入賬處理，以確保企業財務的準確和有效的運作。