企業補繳稅款一般要及時填寫納稅申報表，確認補繳稅款與原定稅款之間的差額，并將差額一次性繳付補稅。補繳稅款后要將原定稅款減去實際補繳金額，結果分兩部分：1、補繳貸方稅額；2、沖抵原定稅額。稅務部門根據納稅人補繳稅款情況，單獨開具補繳稅款對賬單及實繳稅款證明，納稅人在記賬時，要及時將補繳的稅款，記入補繳貸方稅額科目及沖抵原定稅額科目，并歸入期末應交稅費減征額。 拓展知識：稅務登記應滿足稅務機關要求，一般根據稅種、開具發票時間（如月結、季結、期結）以及勾選相應稅種的上級機關要求，開展正確的稅收登記、納稅申報完成賬務處理工作。