技術咨詢費應當計入企業費用項目的科目，具體的科目分類可以根據企業財務統一編制的會計分類指標來確定。一般情況下，技術咨詢費的會計科目應當屬于專門費用“技術咨詢費”，即科目編號為6001-技術服務費；如果企業把技術咨詢費作為一項專業服務費用，去聘請外部的技術服務機構、設計機構提供技術咨詢服務，此時可以將支出費用科目修改為應付賬款（編號2202-應付技術服務費）。 同時，無論是把技術咨詢費作為一項專業服務費用還是作為一項企業費用，都應當將相應的技術咨詢費支出明細數據和收款單據等信息結合起來，作為依據說明此項費用的繳費有效性，進而用以企業內部核銷及外部報稅。