甲公司應當將乙公司作為子公司而不是分公司。如果乙公司作為子公司，甲公司可以在報稅時對虧損做出調整，乙公司的虧損可以疊加到甲公司的有效虧損中，以減少甲公司的稅收負擔。如果將乙公司作為分公司，那么甲公司將不能享受到這一稅務紅利，從而導致財務負擔更大。 拓展知識：甲公司設立乙公司，并不僅僅只考慮虧損和盈利，還有其他一些稅務收入、利用品牌買賣資源、投資和技術開發等等都是需要考慮的因素，以及雙方的發展和合作模式。另外，還要考慮稅務環境、資金配置和風險防控等因素。