當公司沒有收到專票或專票已丟失，但已經抵扣進項稅時，如果不能提供充分的發票證據證明，上級稅務機關將不予辦理抵扣，因此公司可以嘗試向稅務機關申請開具憑證，以確認其抵扣已作業的進項稅。此外，公司還可以向供應商申請補發專票，以確認自己的進項稅抵扣情況。 拓展知識：以上是進項稅抵扣未能提供證據證明的處理方式，而出口退稅的證明證據尤為重要，公司應重視起來，遵守有關出口退稅的規定，提供符合要求的出口憑證，以確保正確準確完整地抵扣退稅稅額。