如果完工百分比確認的收入與實際收到的工程結算不一致，那么應該按照實際收到的工程結算來申報增值稅報表。申報增值稅時，需要注意有關銷售額、進項稅額等，要確保申報的稅額準確無誤。此外，還需按照規定的時間申報增值稅，以避免滯納金等處罰。拓展知識：增值稅申報核算時還需關注相關稅率，比如增值稅率、減免稅率等，這些稅率變動會影響到申報增值稅的數額。