業務招待費在匯算清繳時是可以自動扣除的。一般情況下，根據《企業所得稅匯算清繳管理辦法》的規定，企業可以將一定比例的業務招待費作為稅前扣除項目，扣減企業所得稅，即當企業進行匯算清繳時，可以自動扣除一定比例的業務招待費。 具體來說，根據《企業所得稅匯算清繳管理辦法》（財政部令第20號）第十四條的規定，企業可以將實際發生的業務招待費按照50%的比例作為稅前扣除項目，扣減企業所得稅，即當企業進行匯算清繳時可以自動扣除50%的業務招待費。但是，根據《企業所得稅匯算清繳管理辦法》（財政部令第20號）規定，企業所得稅匯算清繳時，可以自動扣除的有哪些項目，業務招待費只是其中之一，還有勞務費、技術服務費、研究開發費等等。 此外，業務招待費的稅前扣除比例不僅受到《企業所得稅匯算清繳管理辦法》（財政部令第20號）的約束，而且還要受到國家稅務總局發布的各項有關文件中有關企業所得稅匯算清繳時可以自動扣除的項目及比例的約束。