當員工缺勤時，工資應根據公司規定做相應的扣款處理，比如說，如果是病假、事假的，公司一般會扣取當天的工資；如果是曠工，公司會扣取一定比例的工資，并且將曠工記入員工的考勤記錄；如果是遲到、早退，公司也會根據遲到、早退的時間比例扣除相應的工資，將違紀行為記錄在員工考勤記錄中。 扣工資之后，公司可以將員工的工資用不同的方式支付，例如現金支付、銀行打款、轉賬等，每種方式都有其記賬流程，例如現金支付可以用支票開具，銀行打款需要寫出銀行轉賬支票，轉賬也要記賬，等等。在做賬之前，公司要核實每一位員工所缺勤的工作時間，從而進行合理的扣工資處理，公司還要對每一張支票或轉賬憑據進行收票歸類存檔，以便日后審計查詢。 拓展知識：此外，公司有時也會根據不同情況，采取相應的補償待遇或報酬來彌補員工缺勤帶來的損失，具體要根據員工實際情況，結合公司規定來考慮。