應收賬款由業務員先收，后期再和業務員提成相抵扣，應該按照正常的應收賬款管理流程進行處理。首先，根據客戶的收款憑證建立應收賬款；其次，一旦建立應收賬款，就應當與業務員結算，即將收取的款項與業務提成進行抵扣；最后，如果賬款已經收清，就可以做出賬款結算的決議，審核并簽字確認。 此外，為了更有效地監管應收賬款，可以開展定期的財務審計，及時檢查應收賬款的管理和收款情況，以便及時發現異常情況，決定進一步的處理措施。另外，還可以建立擔保機制，以便有效地防止因業務員收賬款不按照規程執行而引起的糾紛。