企業代扣個稅，稅務局退回的手續費，做賬時需要注意以下幾點： 1.首先，要在財務系統中分別錄入稅務局墊付的代扣個稅和退回的手續費，將稅務局發給企業的現金進行收款登記，并記入應收稅款賬戶； 2.同時，要在收款登記的輔助核算項中詳細記錄企業代扣稅款和稅務局退回的手續費的稅種、金額； 3.在稅務局墊付的代扣稅款明細表中，分別記錄企業繳納的每種稅種和稅務局墊付的代扣稅款，應收和已收的金額； 4.及時錄入稅收管理信息，記錄稅務機關收取的稅款及企業代扣和退回的稅款明細； 5.定期核對賬務信息，確保與稅務機關的納稅信息一致，準確處理賬務核算。 稅務局退回的手續費是指企業在繳納稅款時，稅務機關為保證稅款準確、及時、安全收繳而收取的手續費，在申報納稅時，企業可以增加此類費用的抵扣，以減免稅收。此外，也可以把企業支付的手續費用于服務費、管理費等方面，有助于企業降低成本、提高效率。