全電發票的自產自銷農產品發票，原則上應該勾選“按專項發票開具”，在發票上勾選“農產品抵扣”，但是普通全電發票沒有農產品抵扣選項。也就是說，如果開具全電發票，則不能開具專用發票，而普通全電發票無法勾選抵扣中農產品，只能勾選合計金額。 因此，如果對方需要開具專用發票，比如全電發票的自產自銷農產品發票，則應當安排專用發票開具，通常可以開具增值稅普通發票或專用發票。而免稅的普通全電發票無法開具自產自銷農產品發票，而只能勾選合計金額。 此外，另外還可以考慮將農產品作為贈品事先在發票備注中注明，詳細列明農產品，數量，金額等相關情況。這樣，可以使用普通發票，同時能便捷地核算農產品的金額和稅金。