新公司作為扣繳義務人需要做以下幾步操作: 1.提交新員工的個人所得稅起征附加繳稅申報表：扣繳義務人應按月提交勞動者個人所得稅起征附加繳稅申報表（根據勞動者實際繳納社會保險金額，繳納社會保險金附加繳納個人所得稅）。 2.每月把個稅附加費與個人所得稅等一起繳費：扣繳義務人每月應把勞動者實際繳納社會保險金附加繳納個人所得稅與個人所得稅等一起繳納。 3.報送個人所得稅起征附加和個稅附加匯總表：扣繳義務人需要把個人所得稅起征附加和個稅附加匯總表報送至稅局本地稅務機關。 4.定期報送稅收繳納表：扣繳義務人還需要每月定期報送稅收繳納表至稅局本地稅務機關。 以上是關于新公司作為扣繳義務人關于個稅附加的操作，同時也要注意其他相關個人所得稅規定，避免出現違規，以免受到稅務機關的處罰。 拓展知識：個人所得稅是扣繳義務人向稅務機關所繳納的一種稅收，是由勞動者在一定的范圍內的收入所產生的稅收，根據《個人所得稅法》規定，勞動者自行承擔的個人所得稅，可以由扣繳義務人代為扣繳。