1、首先，需要對賬目進行認真的核對，確保數據的準確性。對材料的缺失原因進行分析，包括運輸過程中的損失、管理人員操作失誤等原因，識別出責任單位，并與供應商及負責的部門進行積極溝通，盡量減少經濟損失。 2、扣除供應商的款項，應遵循法律法規，按照一定的流程處理，比如通過雙方簽訂補充協議或變更材料價格等，處理完畢后，審批相應的文件，提交相關人員簽字，以做到供應商與財務部門等相關部門的同意。 3、同時，可以要求供應商在未來的交易中加強質量管控，規范入庫流程，增強對管理責任的貫徹執行、加強商業服務態度。 拓展知識：處理材料盤虧是每個企業必不可少的管理工作，需要做好以下幾個方面的工作： （1）建立有序的材料盤點管理機制，嚴格落實內部質量控制體系，做到材料準入、流程管理、庫存調整等； （2）定期對賬物資庫存進行盤點，及時發現問題，及時予以預防； （3）強化倉儲管理，實施倉庫標準化建設，建立庫存管理體系，提高庫存管理的準確性、及時性與有效性； （4）建立有效的質量控制機制，嚴格執行材料入庫管理，定期考核檢查相關人員是否規范執行管理制度和操作流程。