小規模納稅人開運費專票應該只能開3%，因為按照中國稅法規定，小規模納稅人只能享受簡易征收制度，只能開3%的增值稅專票，而不能開17%的普通增值稅發票，因此開運費專票只能開3%。 而普通納稅人，按照國家稅政優惠政策，運費等服務性收入，納稅人可以憑稅務機關出具的說明書，開17%的增值稅普通發票。 在實施運費專票時，納稅人要做好準備工作：首先應當準備好有效的發票承兌匯票，其次要按照稅務機關規定，準備好部分關于發票申請、開具、開具和使用等相關文件，最后要嚴格按照發票開具條例規定時間，如實填寫發票，保證發票質量。 需要指出的是，除了按照規定開3%的增值稅專票外，企業還可采用抵扣發票來避免增值稅，其要求是：購買的商品或服務要有應稅勞務性質，購買方要有真實的經濟活動，且商品或服務實際傳達后才可以使用。另外，納稅人要嚴格按照發票開具條例規定，否則將受到處罰。