如果總公司收錢，由分公司開票，是可以的。但要按照國家有關規定進行，需要滿足一定的條件。首先，要確保分公司開出的發票項目和金額不能超出總公司的收入賬目，以及對應的稅收賬目。其次，開具的發票應該與總公司的票據保存有關，方便查驗。最后，分公司開發票需要總公司的權限。只有在上述三個條件都符合的情況下，總公司才能收到由分公司開出的發票。 拓展知識：在開出發票的過程中，也要去落實稅收管理制度，主要是準確認定貨物或服務是否屬于收稅范圍，屬于收稅范圍的話，應當按照有關稅務政策和稅收管理制度進行繳納稅款。有關發票開出與稅收管理關系，還可以參考企業所得稅稅種改革和稅務稽查改革，以便符合國家有關規定，確保稅收管理的質量和效率。