老師您好！要代老板付他的房產的契稅，首先需要計算出應付的稅款，無論個人還是企業都應根據相關稅務條例計算出所交稅款數額，并在稅務機關網站或各稅務部門了解相關政策。之后，依據《中華人民共和國稅收法》、《稅收征收管理法》、《稅收征管法實施細則》等有關法律及規定，申請付款申請單，填寫付款申請單，并將需要提供的相關證明材料進行復印，然后送交稅務機關審核后由稅收機關審核確認無誤后撥付賬戶。拓展一下，稅款要及時繳納，避免未交稅款時被稅務機關按照相關法律從重處罰，可以辦理定期繳款計劃，提前計劃好每季度應交稅款數額，按期繳納，及時交稅，免得未交稅帶來負擔。