電子發票的存檔方式一般以紙質版本為主，首先，紙質版本的電子發票應當采用安全的文件夾或文件箱密封保管，發票頁面上的內容應當清晰可見；其次，紙質版本電子發票可以分類存檔，比如，圓珠筆可以寫上存檔編號，一般以“年度-發票代碼-發票號碼”的方式來備案，便于后期快速查找；最后，此外，還可以將電子發票存儲到電腦中，便于檢索和管理，可以建立一個專門的電子發票存檔管理系統，以更有效的管理和存檔電子發票。 拓展知識：另外，采用云式的發票存檔也是一種比較可行的方法，這種方法可以在發票受到損壞或者遺失的情況下，及時進行恢復。云式存檔可以更加靈活、及時、安全地進行發票存檔，而且發票存檔的管理也可以更加精細化。