如果銀行有兩筆款進賬，而沒有開具發票，可以根據收款單約定的條款，就其所提供的證據，憑借其雙方的實際行為，給出符合法律規定的證據，進行事實性的認定；同時，根據收據上的內容，形成法律文書，并簽字確定，以免可能產生糾紛。證據可以是收款單、發票、雙方簽訂的協議，也可以是其他可以證明貨款來源的材料，這些文件都是健全合理的審計和財務管理中不可缺少的組成部分。同時，也可以通過詢問雙方關系人或其他有關人員，以及查詢企業賬戶系統，記載發生的交易，收集可以證明財務情況的證據，有助于實現財務管理的透明化。拓展知識：對企業及其它免稅單位、單位交易，結算時發票明細與結算金額不符，應當采取收支實收實付原則，按實收實付價格進行結算，同時雙方應交易財務憑證，開具正確的發票；及時開具正確的發票有助于完善企業的財務體系，避免產生相關的稅務或其他問題。