個體工商戶核定征收改查帳征收庫存的處理方式，包括：一、首先應進行識別、評估和計算稅收收入增加或減少的情況；二、依據工商部門的具體要求，去檢驗個體工商戶未核定的收入，發現問題并修正；三、對未納稅收入進行查賬，根據核定征收結果，進行調整；四、確認計算工商戶稅收收入增加或減少的金額，完成稅收征收庫存的處理；五、每個月要對上月的收支情況及稅收征收庫存情況進行審計，拿出差錯，進行重新處理，以確保稅收收入有效地征收、完整地統計。拓展知識：個體工商戶稅收征收庫存需要定期更新，除了要求個體工商戶準確計算應稅收入外，還需要確保個體工商戶熱情有序地配合主管稅務機關核實核查。