水利建設專項收入計稅依據是《企業所得稅法》第八十五條有關規定，稅率為25%，即從該項收入中扣除合理的管理費用、管理費和折舊后，計算應納稅額，其稅率為25%，即每5000元的收入需要繳納1250元的稅款。 水利建設專項收入計稅核算中，受稅人可委托會計師事務所出具審計報告，以便核實其納稅義務，以確保賬務公正合法，且支付的稅金準確無誤。同時，受稅人還可以辦理專項收入稅收專戶，每月由受稅人報送的賬戶資料，由稅務機關將稅款轉入該賬戶，以規范稅款收支。 此外，根據相關政策規定，水利建設專項收入中可以準許提取的部分資金也可以不繳稅，但具體情況應隨政策變化而變化，因此，受稅人還應咨詢有關部門以獲取最新政策資訊。