對于作廢的增值稅普通發票第二聯不見了的問題，應該采取以下措施： 一、如果發票第二聯不見了，可及時向開票單位索取復印件，這樣就可以正常使用發票； 二、如果發票第二聯不見了，也可以向當地稅務機關申請補開發票，申請補開發票需要提供申請補換發票的申請書、發票的原件、作廢的發票的第一聯復印件等； 三、如果發票第二聯不見了，也可以向當地稅務機關報損，報損需要提供發票的原件并根據稅務機關的要求提供申報損益發票表格； 四、如果發票第二聯不見了，也可以向當地稅務機關提交申請折損稅款的請求，申請折損稅款需要提供請求書并根據稅務機關的要求提供完整的折損稅款申請表，并將發票的原件一并交回稅務機關。 拓展知識：發票由稅務機關發行，每張發票都是有價證券，一旦缺失或者作廢，就無法申請開具發票。所以，發票作廢時，要慎重對待，以免造成不必要的損失。