苗木發票按照按照發票稅率進行抵扣。根據《中華人民共和國發票管理條例》第五十三條，苗木發票屬于普通發票，稅率為增值稅3%，與普通發票稅率一致。苗木發票只能抵扣增值稅，不能抵扣消費稅。 拓展知識：由于發票的使用場景和發票抵扣方式不同，發票稅率也會有所不同。除了苗木發票的普通發票稅率，還有特殊發票稅率，如機動車發票，稅率為7%，棉花、茶葉發票稅率為3.7%，桑葉、貼膜發票稅率為13%，木材發票稅率為5%等。