是的，大額醫療補助可以從個稅中扣除，比如醫療保險報銷金額超過自費部分的部分，以及本人收入超過其他扣除標準后的部分，都可以從個稅中扣除。但是必須滿足條件才可以實施扣除：（1）本人收入超過其他扣除標準后的部分；（2）使用理賠金額超出自費部分；（3）報銷費用已經扣除完畢，且報銷費用為醫療服務費用。另外，還要確保報銷金額和個人收入都在低于自負金額的限額之內，否則就不能從個稅中扣除了。 個稅扣除大額醫療補助的好處在于可以減輕公民的經濟負擔，讓更多的社會資源可以被合理分配。但是，個人也要注意報銷費用和本人收入不能超過限定的標準，以及認真核對報銷信息，以免由于填寫信息錯誤導致無法從個稅中扣除醫療補助的風險。