一般來說，企業要支付工會經費，首先要求實行電子票據系統，以便實現在電子稅務局系統中填寫工會經費這一項。但是，由于新接到的個人獨資企業尚未實行電子票據系統，所以電子稅務局系統中還沒有工會經費這一項。因此，可以采取下面幾種辦法來解決： 1、將工會經費當作企業社會保險費，由企業負責支付。 2、將工會經費看作企業社會保險費的屬性之一，由企業負責支付。 3、將工會經費申報為個人獨資企業的營業收入，由企業負責支付，并申報個人所得稅。 4、采購工會經費服務，支付企業營業收入，由企業負責支付，并申報個人所得稅。 以上幾種辦法都可以有效地解決電子稅務局系統中沒有工會經費這一項的問題，同時也防止出現稅收避繳現象。另外，由于個人獨資企業不需要申報工會經費，所以可以避免稅務收入繳納及稅務登記等繁雜手續。