3%增值稅專用發票和普通發票的主要區別： 1、開具資格不同：3%增值稅專用發票僅限增值稅一般納稅人開具，普通發票也可以由小規模納稅人開具。 2、發票格式不同：3%增值稅專用發票和普通發票，在發票格式上有明顯的區別。 3、稅率不同：普通發票開征稅率為6%，而3%增值稅專用發票開征稅率為3%。 4、抵扣稅額不同：普通發票可以抵扣稅額，3%增值稅專用發票不能抵扣稅額。 小規模納稅人開具3%增值稅專用發票不能免稅，只能貼現，也就是購貨方只能按貼現價格支付貨款，銷貨方可以從稅務機關獲得貼現后的貨款的收入。而普通發票開征稅率為6%，可以免稅，也可以抵扣進項稅額。具體是否免稅，需要查看發票商品是否為免稅品。 拓展知識：根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》的規定，增值稅一般納稅人開具的有3%、6%、16%、17%四種稅率，開具3%增值稅專用發票。3%稅率適用于具有以國家稅法確定的特定情形、實行零稅率的納稅人，此類商品會被視為免稅商品。