根據國家有關法規，100萬發票的稅費應該為總金額的3%，其中，中國稅法規定，買賣雙方應就貨物及服務支付的增值稅的最低額度為3%。此外，具體稅收另外以當地稅務局規定為準，比如某地的稅務局規定發票金額超過100萬，稅率提高為5%。總之，100萬發票應當繳納3000萬稅費，但具體金額以當地稅務局規定為準。 此外，在發票代開的過程中，如果有復雜的情況，可能需要稅務專業人士的幫助，這樣可以準確計算出從而準確繳納稅費。稅務專業人士可以根據實際情況來確定稅費繳納的額度，還可以提供有效的節稅建議，為企業節約更多的開支。